Panji Gumilang selaku pimpinan Ponpes Al-Zaytun pernah dipenjara selama 10 bulan karena terlibat kasus pemalsuan dokumen.
7. Ponpes Al-Zaytun Sesat
Dalam temuan MUI di tahun 2002 lalu, bahwa Ponpes Al-Zaytun merupakan sesat dan juga berbahaya.
Demikianlah tadi beberapa fakta dan kontroversial mengenai Ponpes Al-Zaytun. (*)